Les Gentils
Réalisant à peine les évènements qui se trament dans l'univers, nos héros partent quand même à l'aventure, parcourant les mondes qu'ils connaissent à la recherche d'informations sur l'Organisation XIII réincarnée ou le nouveau groupuscule nommé Les Coeurs Purs. Ils sont pour le moment tous réunis au château Disney et attendent des renforts demandés par le Roi.
On connait Sora, Riku, Kairi, le Roi Mickey, Dingo, Donald. Cependant la nature et le nombres de leurs alliés potentiels n'a pas été estimé.
Les Coeurs Purs
Groupuscule armé de Keyblades, qui ont changé de camp. Leur arrogance et leur folie les dressent désormais en ennemis. Ils souhaitent éradiquer les Sans-Coeurs mais aussi les humains normaux, afin de créer un univers pur, uniquement constitué de porteurs de Keyblades. Pour cela, ils ont utilisé le Kingdom Hearts pour faire renaître l'Organisation XIII. Grâce à l'Organisation, le groupe des Coeurs Purs seraient doublement gagnants: D'une part, l'Organisation cherchera l'obtention d'une multitude de coeurs pour son Kingdom Hearts, supprimant ainsi les coeurs indignes de la Keyblade, et par la même occasion nos héros. D'autre part, le groupe pourra utiliser le Kingdom hearts artificiel en tant que source de pouvoir illimité.
On ne connait ni le nombres de membres, ni leurs réelles capacités.
L'Organisation XIII
Tout juste renée de ses cendres, l'Organisation n'a pas conscience d'être manipulée. Ou du moins ne possède t-elle qu'un soupçon très vague à ce sujet. Elle ne sait ni comment ni par qui elle a ressuscité. Elle poursuit donc son but initial, qui est de collecter un maximum de coeurs afin de créer un monde artificiel, nommé Kingdom Hearts, et à travers lequel chaque membre pourrait obtenir un coeur et exister pleinement.
Au nombre de 13 individus, comme leur nom l'indique, chacun possède une personnalité différente, malgré leur absence de coeur.
Les indépendants
Insensibles aux grandes histoires de l'univers, ces êtres solitaires poursuivent une quête qui n'appartient qu'à eux seuls. Ils vont de monde en monde, multipliant les expériences et gagnant en puissance. Ils ne souhaitent pas rejoindre ou ne connaissent pas les différents groupes. Que ce soit par vaisseau ou par des portails, chacun met à profit les connexions entre les mondes pour voyager.
Ces individus solitaires possèdent des mentalités et des puissances variées. On ne connait exactement leur nombre, mais certains sont sujets à de nombreuses approches par les groupuscules connus.
Les Sans-Coeurs
Assoiffés de coeurs pour des raisons obscures, ils ne sont plus contrôlés par l'Organisation, mais par des Sans-coeurs intelligents, qui restent dans l'ombre. Leur objectif final est probablement de conquérir les coeurs de tous les mondes.
Le nombre de personnes commandant les sans-coeurs est inconnu mais chaque membre est puissant et totalement abandonné au mal.